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Centro de Biología Molecular “Severo Ochoa” (CSIC y Universidad Autónoma de Madrid). Cantoblanco, 28049-Madrid. rfrancisco@cbm.uam.es
El tallo ribosómico es una estructura de naturaleza proteica altamente conservada en todos los ribosomas. Se encuentra anclado en el dominio GTPasa del rRNA 16S de la subunidad mayor del ribosoma, a través de las proteínas RPP0 y RPL12. Se compone además de las genéricamente denominadas “proteínas ácidas” o “proteínas P” por el hecho de estar fosforiladas. El tallo es una estructura flexible sobre la que interaccionan diferentes factores que participan en el proceso de traducción, siendo el más estudiado el factor de elongación 2.
Distintas evidencias indican que estas proteínas se agrupan en dos familias, P1 y P2, que se unen al ribosoma como heterodímeros P1-P2, siendo la proteína P1 la que ancla al heterodímero sobre la proteína P0. Así, por ejemplo, tan sólo las proteínas P1 dan interacción con P0 en el sistema de doble híbrido clásico. Recientemente hemos utilizado una variante de este sistema en el que las proteínas cuya interacción se quiere estudiar se fusionan al extremo amino de los dominios de GAL4 en lugar de hacerlo al extremo carboxilo. Con este sistema hemos observado que tanto las proteínas P1 como las P2 son capaces de interaccionar con P0. Este dato abre nuevas vías para interpretar el proceso de ensamblaje del tallo ribosómico.
El sistema de doble híbrido también lo hemos utilizado para identificar proteínas que interaccionan con los componentes del tallo ribosómico en Saccharomyces cerevisiae. A vista de los resultados anteriores, se ha repetido el screening de genotecas con construcciones que fusionan las proteínas P al extremo amino del dominio de unión de GAL4. Como resultado, se han identificado proteínas (no encontradas previamente con el sistema convencional) que están implicadas en el proceso de biogénesis de la subunidad mayor del ribosoma, lo que relaciona el tallo ribosómico con el proceso de ensamblaje nucleolar del ribosoma.