Gran parte de la complejidad estructural de las células eucariotas se ha originado mediante procesos endosimbióticos. Asi se supone que se originaron muchos grupos de protistas, como el de los cromoalveolados. Se asume que este último grupo, que incluye a criptofitas, estramenopilos, haptofitas, apicomplejos, dinoflagelados y ciliados, surgió de la endosimbiosis con un alga roja primigenia. El propósito de nuestro trabajo es comprobar si este modelo se ajusta a uno de los grupos incluidos entre los cromoalveolados, los ciliados, ya que no existen datos morfoestructurales o funcionales que atestigüen su pasado fotosintético. El trabajo se ha abordado mediante la búsqueda de vestigios moleculares, de genes, que puedan ser  informativos de un pasado fotosintético. No hemos encontrado ninguna evidencia de tal proceso de endosimbiosis en ciliados.