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Departamento de Microbiología, Instituto de Fermentaciones Industriales, CSIC, C/ Juan de la Cierva 3, 28006 Madrid. rmunoz@ifi.csci.es
Lactobacillus plantarum es una especie de gran interés en microbiología de alimentos puesto que se utiliza como cultivo iniciador en numerosos sustratos. Además, recientemente se han descrito cepas de esta especie que presentan actividades probióticas. La falta de unos métodos moleculares fiables ha impedido realizar estudios para conocer la estructura que presentan las poblaciones en esta especie. El objetivo de este trabajo ha sido desarrollar un sistema de tipado basado en la técnica MLST (multilocus sequence typing) y que además nos permita conocer las interrelaciones existentes entre los aislados de L. plantarum.
Se han estudiado 16 cepas de L. plantarum mediante MLST. Los genes seleccionados han sido: pgm (codifica una fosfoglucomutasa), ddl (D-alanina-D-alanina ligasa), gyrB (subunidad B de la DNA girasa), purK1 (fosforibosilaminoimidazol carboxilasa), gdh (glutamato deshidrogenasa) y mutS (proteína de reparación de errores en el DNA). Además estas cepas se han caracterizado mediante ribotipia y análisis de ISR (16S-23S rDNA intergenic spacer region). Mediante ribotipia las cepas se engloban en 4 grupos, sin embargo mediante el análisis de ISR no se ha observado ninguna diferencia en las cepas analizadas. Por el contrario, la técnica de MLST en L. plantarum presenta una alta capacidad discriminante encontrándose una alta diversidad genética entre las cepas estudiadas. Los análisis filogenéticos realizados indican que la población de L. plantarum no presenta una estructura clonal. Además, la recombinación desempeña un importante papel en crear heterogeneidad genética. Hemos demostrado que la técnica de MLST permite una identificación precisa de las cepas de L. plantarum por lo que representa un método útil para la tipificación de cepas de esta especie.