Genotipo versus fenotipo en la descripción de especies bacterianas: el caso de Pseudomonas stutzeri y P. cloritidismutans.

Cladera, A.M.; García-Valdés, E.; Lalucat, J.

Àrea de Microbiologia. Universitat de les Illes Balears. Crta Valldemossa, km 7,5. 07122 Palma de Mallorca (Illes Balears). vdbsacc4@uib.es

Pseudomonas stutzeri es un microorganismo con una extraordinaria variabilidad fenotípica y genotípica. Debido a esta enorme variabilidad genotípica la especie se subdivide en genomovares, entendiendo a la genomovar como un estatus taxonómico provisional que agrupa a cepas genotípicamente similares dentro de una misma especie. En la actualidad se conocen 18 genomovares diferentes.

Recientemente, Wolterink y colaboradores (2002), aislaron y caracterizaron la cepa AW-1 comparándola con varias cepas de P. stutzeri, sin embargo fue definida como especie nueva dentro del género Pseudomonas, (Pseudomonas chloritidismutans), por su incapacidad de utilizar el nitrato como aceptor de electrones pero si el clorato en una respiración anaeróbica.

Para esclarecer la posición taxonómica de la cepa AW-1 se llevaron a cabo diversos estudios fenotípicos y genómicos con el fin de confirmar la afiliación de la cepa AW-1 como un miembro de la genomovar 3 de P. stutzeri .

En las pruebas fisiológicas se obtuvo una cepa espontáneamente adaptada (AW-1A) capaz de crecer en condiciones desnitrificantes. Se demostró mediante pruebas químicas y mediante la detección de óxido nitroso que esta cepa era capaz de crecer en condiciones selectivas para desnitrificantes.

Además se demostró la presencia de los genes de la desnitrificación nirS y nosZ en la cepa AW-1.

También se llevó a cabo un análisis multilocus con cepas de P. stutzeri y se construyó una árbol consenso resultado de la filogenia molecular conjunta de las secuencias del 16S rDNA, las ITS1 y las de los genes conservados rpoD, gyrB, así como de los genes metabólicos catA y nosZ, que situaron la cepa AW-1 como un miembro de la genomovar 3 de P. stutzeri.

Finalmente se aportaron evidencias de que la capacidad de utilizar el clorato estaba presente en otras cepas de P. stutzeri pertenecientes a otras genomovares diferentes a la gv. 3(cepas Pseudomas sp. PDA, PDB, CFPBD, PK) y de que seguramente se trataba de una característica de transferencia lateral (por la incongruencia observada en los árboles del 16S rDNA y del gen de la clorito dismutasa, (cld), por las diferencias en el contenido en GC% y en los valores de RSCU del gen cld).

Con todos estos argumentos se propone la reclasificación de P. chloritidismutans y considerarlo como un nombre junior de P. stutzeri.